Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms