Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
3425401B19RikD3Z1D3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
3425401B19RikD3Z1D3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms