Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930444P10RikD3YUR1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms