Protein–RNA interactions for Protein: D2XZ31

Scgb1b29, ABPA7 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb1b29D2XZ31 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scgb1b29D2XZ31 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scgb1b29D2XZ31 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scgb1b29D2XZ31 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scgb1b29D2XZ31 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scgb1b29D2XZ31 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scgb1b29D2XZ31 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scgb1b29D2XZ31 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scgb1b29D2XZ31 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scgb1b29D2XZ31 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scgb1b29D2XZ31 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scgb1b29D2XZ31 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scgb1b29D2XZ31 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scgb1b29D2XZ31 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scgb1b29D2XZ31 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scgb1b29D2XZ31 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scgb1b29D2XZ31 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scgb1b29D2XZ31 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scgb1b29D2XZ31 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms