Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptprz1B9EKR1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms