Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmf1B9EKI3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
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