Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms