Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ppfia4B8QI36 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppfia4B8QI36 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms