Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syce3B5KM66 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms