Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Phf11bB4XVQ1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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