Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppfia1B2RXQ2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfia1B2RXQ2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms