Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc11B2RXC1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc11B2RXC1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms