Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rd3lB2RV38 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms