Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otud7bB2RUR8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud7bB2RUR8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms