Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms