Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zscan5bB2RTN3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zscan5bB2RTN3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms