Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
JrklB2RRL2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
JrklB2RRL2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
JrklB2RRL2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
JrklB2RRL2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
JrklB2RRL2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
JrklB2RRL2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
JrklB2RRL2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
JrklB2RRL2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
JrklB2RRL2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
JrklB2RRL2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
JrklB2RRL2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
JrklB2RRL2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
JrklB2RRL2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
JrklB2RRL2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
JrklB2RRL2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
JrklB2RRL2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
JrklB2RRL2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
JrklB2RRL2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
JrklB2RRL2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
JrklB2RRL2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
JrklB2RRL2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
JrklB2RRL2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms