Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud4B2RRE7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud4B2RRE7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms