Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf3B2RQG2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf3B2RQG2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms