Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CK137956B1AYM9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CK137956B1AYM9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CK137956B1AYM9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CK137956B1AYM9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CK137956B1AYM9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CK137956B1AYM9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CK137956B1AYM9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CK137956B1AYM9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CK137956B1AYM9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CK137956B1AYM9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CK137956B1AYM9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CK137956B1AYM9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CK137956B1AYM9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CK137956B1AYM9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CK137956B1AYM9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CK137956B1AYM9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CK137956B1AYM9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CK137956B1AYM9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CK137956B1AYM9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms