Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trabd2bB1ATG9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trabd2bB1ATG9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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