Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Spocd1B1ASB6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spocd1B1ASB6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spocd1B1ASB6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms