Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prr29B1ARI9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prr29B1ARI9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms