Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp36B1AQJ2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp36B1AQJ2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp36B1AQJ2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms