Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Odf2A3KGV1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Odf2A3KGV1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms