Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Htra4A2RT60 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Htra4A2RT60 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Htra4A2RT60 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms