Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Samt1A2BED8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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