Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ism1A2ATD1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ism1A2ATD1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms