Protein–RNA interactions for Protein: A2APU8

Fam205a, Protein FAM205A, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam205aA2APU8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam205aA2APU8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam205aA2APU8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fam205aA2APU8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fam205aA2APU8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fam205aA2APU8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Fam205aA2APU8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam205aA2APU8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam205aA2APU8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam205aA2APU8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam205aA2APU8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam205aA2APU8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam205aA2APU8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam205aA2APU8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms