Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CtcflA2APF3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtcflA2APF3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms