Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lcn6A2AJB9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms