Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ76

Hmcn2, Hemicentin-2, mousemouse

Predictions only

Length 5,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmcn2A2AJ76 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmcn2A2AJ76 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmcn2A2AJ76 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms