Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ambra1A2AH22 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms