Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap5A2AGT5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms