Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C87977A2A958 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C87977A2A958 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C87977A2A958 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C87977A2A958 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C87977A2A958 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C87977A2A958 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C87977A2A958 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C87977A2A958 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C87977A2A958 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C87977A2A958 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C87977A2A958 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C87977A2A958 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C87977A2A958 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C87977A2A958 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C87977A2A958 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C87977A2A958 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C87977A2A958 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C87977A2A958 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C87977A2A958 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
C87977A2A958 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C87977A2A958 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C87977A2A958 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C87977A2A958 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C87977A2A958 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C87977A2A958 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C87977A2A958 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C87977A2A958 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C87977A2A958 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C87977A2A958 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C87977A2A958 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C87977A2A958 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C87977A2A958 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms