Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chd5A2A8L1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd5A2A8L1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms