Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Calcoco2A2A6M5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Calcoco2A2A6M5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Calcoco2A2A6M5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Calcoco2A2A6M5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Calcoco2A2A6M5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Calcoco2A2A6M5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Calcoco2A2A6M5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Calcoco2A2A6M5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Calcoco2A2A6M5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Calcoco2A2A6M5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Calcoco2A2A6M5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Calcoco2A2A6M5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Calcoco2A2A6M5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Calcoco2A2A6M5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Calcoco2A2A6M5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms