Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms