Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms