Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SUK1

AW822073, Expressed sequence AW822073, mousemouse

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AW822073A0A0N4SUK1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AW822073A0A0N4SUK1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AW822073A0A0N4SUK1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AW822073A0A0N4SUK1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AW822073A0A0N4SUK1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AW822073A0A0N4SUK1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AW822073A0A0N4SUK1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AW822073A0A0N4SUK1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AW822073A0A0N4SUK1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AW822073A0A0N4SUK1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AW822073A0A0N4SUK1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AW822073A0A0N4SUK1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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AW822073A0A0N4SUK1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
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AW822073A0A0N4SUK1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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AW822073A0A0N4SUK1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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AW822073A0A0N4SUK1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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AW822073A0A0N4SUK1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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AW822073A0A0N4SUK1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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AW822073A0A0N4SUK1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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AW822073A0A0N4SUK1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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AW822073A0A0N4SUK1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AW822073A0A0N4SUK1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms