Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H4

Trbv19, T cell receptor beta, variable 19 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv19A0A0B4J1H4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Trbv19A0A0B4J1H4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv19A0A0B4J1H4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Trbv19A0A0B4J1H4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv19A0A0B4J1H4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Trbv19A0A0B4J1H4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Trbv19A0A0B4J1H4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Trbv19A0A0B4J1H4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv19A0A0B4J1H4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv19A0A0B4J1H4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv19A0A0B4J1H4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv19A0A0B4J1H4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv19A0A0B4J1H4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv19A0A0B4J1H4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv19A0A0B4J1H4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Trbv19A0A0B4J1H4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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