Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B654

Trav3-4, T cell receptor alpha variable 3-4 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav3-4A0A075B654 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trav3-4A0A075B654 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trav3-4A0A075B654 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trav3-4A0A075B654 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav3-4A0A075B654 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav3-4A0A075B654 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav3-4A0A075B654 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav3-4A0A075B654 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav3-4A0A075B654 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav3-4A0A075B654 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav3-4A0A075B654 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav3-4A0A075B654 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav3-4A0A075B654 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav3-4A0A075B654 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav3-4A0A075B654 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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