Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms