Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Top3bQ9Z321 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Top3bQ9Z321 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms