Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Homer1Q9Z2Y3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Homer1Q9Z2Y3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Homer1Q9Z2Y3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms