Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Robo3Q9Z2I4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Robo3Q9Z2I4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Robo3Q9Z2I4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Robo3Q9Z2I4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Robo3Q9Z2I4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Robo3Q9Z2I4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Robo3Q9Z2I4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Robo3Q9Z2I4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Robo3Q9Z2I4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Robo3Q9Z2I4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Robo3Q9Z2I4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Robo3Q9Z2I4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Robo3Q9Z2I4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Robo3Q9Z2I4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Robo3Q9Z2I4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Robo3Q9Z2I4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Robo3Q9Z2I4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Robo3Q9Z2I4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Robo3Q9Z2I4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms