Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z211

Pex11a, Peroxisomal membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex11aQ9Z211 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pex11aQ9Z211 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pex11aQ9Z211 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms