Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Ap3b1Q9Z1T1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ap3b1Q9Z1T1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms