Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf1Q9Z1B8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf1Q9Z1B8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf1Q9Z1B8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf1Q9Z1B8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf1Q9Z1B8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf1Q9Z1B8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf1Q9Z1B8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf1Q9Z1B8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf1Q9Z1B8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf1Q9Z1B8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf1Q9Z1B8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf1Q9Z1B8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf1Q9Z1B8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf1Q9Z1B8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf1Q9Z1B8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf1Q9Z1B8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf1Q9Z1B8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf1Q9Z1B8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf1Q9Z1B8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf1Q9Z1B8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf1Q9Z1B8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf1Q9Z1B8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf1Q9Z1B8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf1Q9Z1B8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf1Q9Z1B8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf1Q9Z1B8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf1Q9Z1B8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms