Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z199

Supt4h1b, Transcription elongation factor SPT4-B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt4h1bQ9Z199 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Supt4h1bQ9Z199 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Supt4h1bQ9Z199 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Supt4h1bQ9Z199 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Supt4h1bQ9Z199 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Supt4h1bQ9Z199 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Supt4h1bQ9Z199 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Supt4h1bQ9Z199 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Supt4h1bQ9Z199 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Supt4h1bQ9Z199 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Supt4h1bQ9Z199 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Supt4h1bQ9Z199 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Supt4h1bQ9Z199 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Supt4h1bQ9Z199 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Supt4h1bQ9Z199 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms